В мире, где глобальная катастрофа оставила неизгладимый след, технологии стали спасением и проклятием одновременно. Япония, превратившаяся в центр невероятного научного прогресса, стала свидетелем того, как кибернетика изменила жизнь людей до неузнаваемости. Искусственные тела, виртуальная реальность, передача мыслей и чувств — то, что казалось фантастикой, стало обыденностью. Люди, связанные единой сетью, теперь могут обмениваться знаниями и эмоциями в реальном времени. Система "Призраки", наделяющая каждого гражданина возможностью взаимодействовать на совершенно новом уровне, разрушила границы между разумом и физической оболочкой.
Однако с этим чудом пришла и опасность. Кибер-террористы, обладающие способностью вмешиваться в сознание людей и управлять их телами, стали новой глобальной угрозой. Они крадут не только информацию, но и личности, превращаясь в призраков, скрытых за маской анонимности. Когда загадочный киборг совершает дерзкое убийство премьер-министра Японии, мир оказывается на грани хаоса. Майор Мотоко Кусанаги, киборг с человеческой душой, возглавляет команду спецоперативников, чтобы пресечь волну террора и остановить вирус Fire-Starter, который угрожает всему человечеству.